HJ63匹配DNA序列-正则+字符串切割

描述

一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例（定义为 GC-Ratio ）是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。给定一个很长的 DNA 序列，以及限定的子串长度 N ，请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等，但是没有 AGT ， CT 等等数据范围：字符串长度满足 1≤n≤1000  ，输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母

输入描述：

输入一个string型基因序列，和int型子串的长度

输出描述：

找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串

示例1

输入：

ACGT
2

输出：

CG

说明：

ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个，其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5，CG为1，故输出CG

import java.util.*;
public class Main{
    public static void main(String [] args){
        Scanner sc = new Scanner(System.in);
        while(sc.hasNext()){
            String str = sc.nextLine();
            int n = Integer.parseInt(sc.nextLine());
            double len = 0.0;
            String result = "";
            for(int i = 0 ; i < str.length() - n+1 ; i++){
                String aim = str.substring(i, i + n);
                String res = aim.replaceAll("[^CG]","");
                double cur = (double)res.length() / (double) n;
                if( cur > len){
                    len = cur;
                    result = aim;
                }
            }
            System.out.println(result);
        }
    }
}